CT是一种新型的无损伤的诊断方法。CT检查可以清晰的显示肝、胆、胰的形态和结构，对诊断肝脏疾病有很大的帮助。CT检查可以用来确定脂肪肝的有无及其程度。CT检查不受腹部脂肪和结肠等含气脏器的干扰，因此对脂肪肝的诊断及其程度的判断优于B超检查，且能确认局灶性脂肪肝。CT检查价格昂贵，且有一定放射性，CT检查并不是诊断脂肪肝的常用方法。
CT平扫诊断脂肪肝的敏感性优于增强扫描，后者仅对中重度脂肪肝有诊断价值。如果肝脏密度（CT值）低于脾脏或肝/脾CT值之比《1即可诊断为脂肪肝。肝/脾CT值之比可作为衡量脂肪肝程度的参考标准，或作为随访疗效的依据。肝脏密度降低，CT值稍低于或等于脾脏，肝/脾比值《1.0为轻度；肝/脾CT比值《0.7，肝内血管密度等于肝密度，肝内血管显示不清者为中度；肝密度显著降低甚至呈负值，肝/脾CT比值《0.5，肝血管密度明显高于肝密度者为重度。
增强CT图像上脂肪肝实质密度虽有增高但低于脾脏，而肝内血管显影更加清晰。血管可变细变窄，但无推移、包绕现象。局灶性脂肪肝常发生于左叶内侧段，表现为局灶性肝内低密度影，呈扇形或不规则形，少数可呈球形或结节状，病灶常延及肝的表面，密度一般较均匀。增强扫描后CT值略升，而其内血管，正常肝区和脾脏明显强化，使脂肪肝区的低密度更加清晰。当CT显示低密度病灶怀疑为脂肪肝而又难以于肝癌和转移瘤鉴别时，可进一步作MRI或B超引导下肝穿刺活检。
